Stækkun líffræðilegrar smásjár er venjulega lítil, á bilinu 40x til 1000x. Þetta er vegna þess að lífsýni eru venjulega gegnsæ og þurfa hóflega stækkun til að fylgjast með uppbyggingu frumna og vefja.
Í líffræðilegri smásjá er stækkunin ákvörðuð af samsetningu hlutlinsunnar og augnglersins. Algengar stækkunarhlutir linsu eru 4x, 10x, 40x og 100x, en augnglerið er venjulega með 10x stækkun. Þess vegna er hámarksstækkun dæmigerðrar líffræðilegrar smásjár 100x hlutlæg margfaldað með 10x augngleri, sem jafngildir 1000x.
Það er mikilvægt að hafa í huga að stækkun líffræðilegrar smásjár er ekki eins mikil og rafeindasmásjár vegna þess að lífsýni eru oft flókin í uppbyggingu og athugunarferlið krefst þess að viðhalda lífvænleika og heilleika sýnanna. Að auki er upplausn líffræðilegrar smásjár einnig mikilvæg þar sem líffræðileg mannvirki eru oft mjög lítil og þurfa mikla upplausn til að fylgjast með fínum smáatriðum.
Í ákveðnum sérhæfðum forritum sem krefjast meiri stækkunar, eins og meinafræðilegra rannsókna eða örskurðaðgerða, er hægt að nota augngler með hærri stækkun (td 16x eða hærra) ásamt viðeigandi augngleri til að ná meiri stækkun. Hins vegar krefjast þessar athuganir með mikla stækkun venjulega flóknari sýnis undirbúning og smásjártækni og krefjast meiri færni frá rekstraraðilanum.